孙博    助理教授、研究员
所在学院生命科学与技术学院
研究方向单分子酶学
联系方式sunbo@@shanghaitech.edu.cn


个人简介
2004年毕业于吉林大学,获工学学士学位;2009年毕业于中国科学院物理研究所,获生物物理学博士学位;2009年至2015年在美国康奈尔大学及霍华德休斯医学研究所从事博士后研究;2015年9月加入上海科技大学生命科学与技术学院任助理教授、研究员。

主要研究内容
单分子技术作为新兴的分子生物学实验手段以单生物分子为研究对象,能够精确解析酶反应过程并区分生物分子在反应过程中的特异性。单分子操纵技术如光镊(optical tweezers)通过操纵单根分子来跟踪酶反应的动态过程,单分子荧光技术如荧光共振能量转移(FRET)通过荧光标记来实时监测蛋白构型及核酸分子的动态变化。我们实验室将专注结合两类单分子技术,发挥各自优势,多维度研究核酸互作蛋白,尤其是马达蛋白(例如:解旋酶,核酸酶等)的酶反应动力学过程及其相应的分子机制,为解决由该类蛋白引起的疾病提供相应的分子生物学基础。同时,我们希望发展新的单分子技术以满足相应的实验要求。

代表性论文


1.    Sun, B.*, Singh, A., Sultana, S., Inman, J.T., Patel, S.S.,and Wang, M.D.* Helicase promotes replication re-initiating from an RNA transcript. Nat Commun, 9, 2306 (2018). (* Corresponding author)

2.    Sun, B. and Wang, M.D. Single-molecule optical-trapping techniques to study molecular mechanisms of a replisome. Methods Enzymol,582, 55-84 (2017).

3.    Sun, B. and Wang, M.D. Single-molecule perspectives on helicase mechanisms and functions. Crit Rev Biochem Mol Biol,51, 15-25 (2016).

4.    Sun, B., Pandey, M., Inman, J.T., Yang, Y., Kashlev, M., Patel, S.S.,and Wang, M.D. T7 replisome directly overcomes DNA damage. Nat Commun,6, 10260 (2015).

5.    Sun, B.#, Johnson, D.S.#, Patel, G., Smith, B.Y., Pandey, M., Patel, S.S.,and Wang, M.D. ATP-induced helicase slippage reveals highly coordinated subunits. Nature,478, 132-135 (2011). (# Equal Contribution)

6.    Patel, G., Johnson, D.S., Sun, B., Pandey, M., Yu, X., Egelman, E.H.,Wang, M.D., and Patel, S.S. A257T linker region mutant of T7 helicase-primase protein is defective in DNA loading and rescued by T7 DNA polymerase. J Biol Chem286, 20490-20499 (2011).

7.    Sun, B., Wei, K.J., Zhang, B., Zhang, X.H., Dou, S.X., Li, M., and Xi, X.G. Impediment of E. coli UvrD by DNA-destabilizing force reveals a strained-inchworm mechanism of DNA unwinding. EMBO J,27, 3279-3287 (2008).

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