赵素文    助理教授、研究员
所在学院生命科学与技术学院
iHuman研究所
研究方向计算生物学
联系方式zhaosw@@shanghaitech.edu.cn
 
 个人简介 
2004年获得中国科学技术大学高分子物理专业学士学位(导师:郭庆祥)。2009年获得美国哥伦比亚大学化学专业博士学位(导师:Richard A. Friesner)。2010-2014 在美国加州大学旧金山分校药物化学系做博士后(导师:Matthew P. Jacobson)。2014年加入上海科技大学iHuman研究所任研究副教授、研究员,加入上海科技大学生命科学与技术学院任助理教授。
 主要研究内容 
GPCR全长结构预测;GPCR和其它细胞信号传导通路蛋白的配体预测。
 代表性论文 
                                        [1] S. Zhao, R. Kumar, A. Sakai, M. W. Vetting, B. M. Wood, S. Brown, J. B. Bonanno, B. S. Hillerich, R. D. Seidel, P. C. Babbitt, S. C. Almo, J. V. Sweedler, J. A. Gerlt, J. E. Cronan, and M. P. Jacobson, “Discovery of new enzymes and metabolic pathways by using structure and genome context”, Nature, 502, 698-702 (2013).
[2] S. Zhao, A. Sakai, X. Zhang, M. W. Vetting, R. Kumar, B. Hillerich, B. San Francisco, J. Solbiati, A. Steves, S. Brown, E. Akiva, A. Barber, R. D. Seidel, P. C. Babbitt, S. C. Almo, J. A. Gerlt and M. P. Jacobson, “Prediction and characterization of enzymatic activities guided by sequence similarity and genome neighborhood networks”, eLife, e03275 (2014).
[3] M. P. Jacobson, C. Kalyanaraman, S. Zhao and B. Tian, “Leveraging structure for enzyme function prediction: methods, opportunities, and challenges”, Trends Biochem. Sci.,39(8), 363-71 (2014).
[4] R. Kumar, S. Zhao, A. Sakai, M. W. Vetting, B. M. Wood, S. C. Almo, J. V. Sweedler, J. A. Gerlt, J. E. Cronan, and M. P. Jacobson, “Prediction and biochemical demonstration of a catabolic pathway for the osmoprotectant, proline betaine”, mBio,5, (2014).
[5] S. Zhao, K. Zhu, J. Li, R. A. Friesner, “Progress in super long loop prediction”, Proteins, 79, 2920-2935 (2011).                                    

浏览次数:6573

返回原图
/