窦坤    助理教授、研究员
所在学院生命科学与技术学院
研究方向转座子生物学与表观遗传
联系方式doukun@@shanghaitech.edu.cn


个人简介

窦坤博士2009年本科毕业于湖南大学生物技术系;2014年博士毕业于北京师范大学/北京生命科学研究所(NIBS)联合培养项目,师从何新建老师学习表观遗传学,后在NIBS袭荣文研究组接受一年博士后训练开始进行果蝇研究;2015年至2019年在美国卡耐基科学研究所(约翰霍普金斯大学校区)进行博士后研究,,师从张钊博士(现任杜克大学教授)和Allan Spradling博士(美国科学院院士)研究果蝇转座子与表观遗传;20201月加入上海科技大学生命科学与技术学院任助理教授、研究员。

窦坤博士长期从事转座子与表观遗传机制研究。相关工作发表于Nucleic Acid Research (2013)Cell Research   (2014)Developmental Cell (2018)Cell (2018) 等国际知名学术期刊。其中,在Cell上发表的工作通过直接追踪转座子的转座事件,揭示了转座子作为一种寄生元件能够攻击宿主的特定发育阶段,以实现自身的有效扩增。该文章发表后第一时间被Popular Science, Science Daily等知名媒体进行了报导。本人也作为特邀报告人在卡耐基研究所总部投资人会议中向各界精英汇报了此项工作。


主要研究内容

转座子,又称跳跃基因,占人类基因组45%以上,并广泛存在于动植物中。转座子跳跃可引起基因组不稳定性,引发疾病甚至癌症。目前已知超过75种疾病可由转座子跳跃引起,例如转座子LINE1插入FVIII基因引起血友病,插入抑癌基因APC引发结肠癌等,因此进行转座子的研究对人类健康有重要意义。

    本研究组以果蝇为主要模式生物,利用其遗传工具丰富、繁殖周期短等优势,探寻转座子的作用机制,包括1)转座子如何被宿主抑制, 2)转座子如何在宿主内实现增殖,以期为预防转座子引发的疾病提供新思路,并在哺乳动物中验证其保守性。


代表性论文


1.   Kun Dou*, Yanchao Liu, Yingpei Zhang, Chenhui Wang, Ying Huang*, ZZ Zhao Zhang* (2020). Drosophila P75 safeguards oogenesis by preventing H3K9me2 spreading. Journal of Genetics and Genomics (In press) (*, Corresponding authors)


2.   Lu Wang#, Kun Dou#, Sungjin Moon, Frederick J. Tan, ZZ Zhao Zhang. (2018). Hijacking oogenesis enables massive propagation of LINE and retroviral transposons. Cell. 2018. Aug 23;174(5):1082-1094.e12. (Equally contributed, voluntarily to be the latter one)


3.   Dou K#, Huang CF#, Ma ZY, Zhang CJ, Zhou JX, Huang HW, Cai T, Tang K, Zhu JK, He XJ. (2013). The PRP6-like splicing factor STA1 is involved in RNA-directed DNAmethylation by facilitating the production of Pol V-dependent scaffold RNAs.Nucleic Acids Research. 2013 Oct;41(18):8489-502. (#, equally contributed)


4.   Han YF#, Dou K#, Ma ZY, Zhang SW, Huang HW, Li L, Cai T, Chen S, Zhu JK, He XJ. (2014). SUVR2 is involved in transcriptional gene silencing   by associating with SNF2-related chromatin-remodeling proteins in Arabidopsis.Cell Research. 2014 Dec;24(12):1445-65. (#, equally contributed)


5.   Moon S, Madeline C, Lin Y, Wang L, Dou K, Zhang ZZ. (2018). A robust transposon-endogenizing response from germline stem cells. Developmental Cell. 2018 Dec 3;47(5):660-671.e3


6.   Wang CH, Guo X, Dou K, Chen H, Xi R. (2015). Ttk69 acts as a master repressor of enteroendocrine cell specification in   Drosophila intestinal stem cell lineages. Development. 2015 Oct 1;142(19):3321-31.


7.   Zhang CJ, Zhou JX, Liu J, Ma ZY, Zhang SW, Dou K, Huang HW, Cai T, Liu R, Zhu JK, He XJ. (2013). The splicing machinery promotes   RNA-directed DNA methylation and transcriptional silencing in Arabidopsis. EMBO Journal. 2013 Apr 17; 32(8):1128-40.


8.   Li P, Li J, Li M, Dou K, Zhang MJ, Suo F, Du LL. (2012). Multiple end joining mechanisms repair a chromosomal DNA break in fission yeast. DNA Repair (Amst).   2012 Feb 1;11(2):120-30

 



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