当今的生命科学研究向精准、定量及全局化的方向不断发展，生物质谱技术被公认为精确、定量、系统性研究生命体系不可或缺的一项关键技术，而基于质谱的组学研究已发展生成为现代精准医学和生命科学的核心研究手段。
水雯箐课题组联合运用生物质谱、蛋白质组学、生物信息学与分子药理学等手段，针对膜受体蛋白家族开展配体筛选与功能蛋白质组学研究，促进新型配体发现与新药物靶点的挖掘。主要研究方向包括：
（1）发展亲和质谱技术，用于药物靶标的配体筛选和受体-配体相互作用研究
发展高通量、定量测量蛋白质-小分子相互作用的亲和质谱技术，用于多种药物靶标蛋白的配体筛选，为药物候选分子早期发现建立新型关键技术。我们近年来拓展亲和质谱技术，使之专门适用于G蛋白偶联受体的配体筛选和功能研究，为这一类高难度的膜受体药靶家族搜寻新型配体，助力于候选药物分子发现。
（2）发展蛋白质组学技术与生信工具，对神经系统疾病挖掘潜在的膜受体药物靶点，阐释疾病发生发展新机制
建立膜受体蛋白质组学技术，实现对动物组织中多种跨膜蛋白家族的深度组学解析；通过对精神类或神经性疾病的膜蛋白质组学研究，发现疾病相关的全新调控因子和分子机制，为该疾病的药物研发提供可能的新治疗靶点。在开展蛋白质组学实验的同时，也注重发展生物信息学策略和工具，从而深度解析疾病相关的多维度组学数据。
（3)发展结构质谱技术，用于探索G蛋白偶联受体的结构动态性
通过发展多种不同特色的结构质谱技术，并与蛋白质结构建模与结构预测方法相结合，从而全面描绘溶液相或细胞环境中的GPCR及其信号复合物的构象集合体。这些独特的结构动态信息能够促进我们对近生理条件下GPCR激活机制的理解，也有望为基于结构的药物设计提供新思路。