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陈佳, PhD副教授 研究员 博士生导师

电话:

邮箱: chenjia@@shanghaitech.edu.cn

传真: 86-21-20685430

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DNA 修复、基因编辑与癌症发生研究组

课题组长

姓名:

陈佳副教授 研究员 博士生导师, PhD, 副教授

职务:

所在院所:

生命科学与技术学院

荣誉称号:

上海市生化与分子生物学会“青年新锐”

教育经历:
  • 1998/09—2002/06,南开大学,学士
  • 2002/09—2009/04,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所,博士
博士后及工作经历:
  • 2009/07—2014/06,美国国立卫生研究院,博士后
  • 2014/11—2019/09,上海科技大学,生命科学与技术学院,助理教授(TENURE-TRACK)
  • 2019/10—至今,上海科技大学,生命科学与技术学院,副教授(TENURED)

课题组简介

研究方向:
DNA 修复、基因编辑、癌症发生
研究内容:

物种繁衍与基因组的稳定性密切相关,然而在某些生理、病理状态下细胞会激活错误倾向性DNA修复机制,因此DNA修复精确性和错误倾向性之间的平衡对于疾病发生、衰老和进化都具有重要的意义。

基因编辑是利用可设计的核酸结合模块蛋白通过碱基插入、缺失、置换等方式对生物体基因组DNA特定位点进行改造从而达到对目标基因进行编辑的一种基因工程,可广泛应用于生命科学基础研究、生物技术开发、农业技术开发以及医药研发等领域。传统的CRISPR/Cas基因编辑技术虽然具有较高的基因敲除效率,但在执行碱基替换等精准编辑时效率通常较低。近年内,将CRISPR/Cas与核酸修饰酶整合发展出的碱基编辑和导向编辑等新型基因编辑系统,可在基因组实现高效率和高产物纯度的靶向性编辑改造。

我们实验室将深入探索DNA修复在基因编辑、疾病发生以及衰老等过程中所起的作用,并开展新型基因编辑系统的构建与应用,主要集中于以下几个方面: 1)研究DNA修复在基因编辑过程中引发突变的分子机制;2)创建具有高精准性的新型基因编辑系统;3)揭示DNA修复引发突变在癌症发生以及衰老过程中的作用;4)开展疾病的基因编辑治疗探索。我们的研究将有助于发展新型基因编辑治疗方法、揭示癌症发生的新机制以及完善衰老的DNA损伤学说。

课题组网站:

研究成果展示

1)实验室长期从事DNA修复以及基因编辑相关的研究工作,阐明了胞嘧啶脱氨酶APOBECCRISPR/Cas9介导的基因编辑过程中产生突变的分子机制,创建了具有更高产物纯度和更高效率的增强型Cas9碱基编辑器(eBE)、可在基因组A/T富集区域内开展有效编辑的Cpf1碱基编辑器(dCpf1-BE)、可在G/C富集区域和高甲基化区域内开展高效编辑的普适型Cas9碱基编辑器(hA3A-BE)、不激活DNA损伤响应通路的dCas12a碱基编辑器(BEACON)以及同时消除gRNA依赖性和gRNA非依赖性脱靶突变的变形式碱基编辑器(tBE),检测了导向编辑系统PE3在在全基因组和全转录组范围内的脱靶效应并构建了新型导向编辑系统sPEaPE。。

2)获得两项中国专利授权:1、一种碱基编辑系统及其构建和应用方法(ZL201710239348.X),2、一种基因碱基编辑器(ZL201810185384.7)。

3)提交三项国际专利(PCT)申请:A CRISPR/Cpf1-based base editing systemFusion proteins for base editing Fusion protein for improved precision in base editing

代表性论文(*第一作者,#通讯作者)

专著

专利

项目

奖励

  • 1. 2016年,上海科技大学产业实践优秀指导教师
  • 2. 2017年,上海科技大学书院“我最喜爱的导师”
  • 3. 2018年,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心青年骨干
  • 4. 2018年,上海科技大学社会实践优秀指导教师
  • 5. 2019年,上海市生物化学与分子生物学会“青年新锐”奖
  • 6. 2019年,中国生物化学与分子生物学会基因专业分会委员
  • 7. 2019年,中国遗传学会基因组编辑专业分会委员
  • 8. 2019年,中国医药生物技术协会基因编辑技术分会委员
  • 9. 2019年,上海市生物化学与分子生物学会常务理事
  • 10. 2019年,上海科技大学第二届创新创业大会创业组三等奖
  • 11. 2020年,中国生物工程学会动物生物技术专业委员会委员
  • 12. 2021年,张江国家自主创新示范区杰出创新创业人才
  • 13. 2021年,上海市细胞生物学会理事

课题组成员及合影

  • 姓名:吴晶
    身份:高级工程师
    在组时间:2015/01-至今
    邮箱:wujing@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:雷丽群
    身份:博士研究生
    在组时间:2014/09-2019/08
    邮箱:Leilq@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:李潇飒
    身份:博士研究生
    在组时间:2014/09-2019/08
    邮箱:lixs@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:王丽洁
    身份:博士研究生
    在组时间:2015/07-2020/12
    邮箱:wanglj1@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:王潇
    身份:博士研究生
    在组时间:2016/09-至今
    邮箱:wangxiao4@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:高润泽
    身份:博士研究生
    在组时间:2016/09-至今
    邮箱:gaorz@@shanghiatech.edu.cn
  • 姓名:韩炆艳
    身份:博士研究生
    在组时间:2017/09-至今
    邮箱:hanwy@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:丁诚峰
    身份:博士研究生
    在组时间:2017/09-至今
    邮箱:dingchf@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:周丽娜
    身份:博士研究生
    在组时间:2018/09-至今
    邮箱:zhouln@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:李吉方
    身份:博士研究生
    在组时间:2018/09-至今
    邮箱:lijf@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:李光业
    身份:博士研究生
    在组时间:2019/09-至今
    邮箱:ligy@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:刘成芳
    身份:博士研究生
    在组时间:2019/09-至今
    邮箱:liuchf@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:赵明丽
    身份:硕士研究生
    在组时间:2020/09-至今
    邮箱:zhaoml@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:许文超
    身份:硕士研究生
    在组时间:2020/09-至今
    邮箱:xuwc@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:朱俊杰
    身份:硕士研究生
    在组时间:2020/09-至今
    邮箱:zhujj@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:陈果
    身份:硕士研究生
    在组时间:2021/09-至今
    邮箱:chenguo@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:闵智博
    身份:硕士研究生
    在组时间:2021/09-至今
    邮箱:minzb@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:樊煜航
    身份:硕士研究生
    在组时间:2021/11-至今
    邮箱:fanyh@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:陈苗苗
    身份:本科生
    在组时间:2016/10-2017/09;2018/09-2019/08
    邮箱:chenmm@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:张聿茜
    身份:本科生
    在组时间:2016/12-2017/09
    邮箱:zhangyq@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:王瑞璇
    身份:本科生
    在组时间:2017/09-2018/08
    邮箱:wangrx@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:朱威
    身份:本科生
    在组时间:2018/03-2019/02
    邮箱:zhuwei@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:王梓先
    身份:本科生
    在组时间:2018/09-至今
    邮箱:wangzx1@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:刘百川
    身份:本科生
    在组时间:2019/08-至今
    邮箱:liubch@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:李潇飒
    身份:访问学者
    在组时间:2019/09-至今
    邮箱:lixs@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:刘舒
    身份:访问学生
    在组时间:2019/09-至今
    邮箱:liu970105@@163.com


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