课题组长
姓名：
丁明瑞助理教授 研究员 博士生导师, PhD, 助理教授
职务：
所在院所：
生命科学与技术学院
荣誉称号：
教育经历：
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2010/9—2014/6，安徽大学，学士
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2014/9—2019/11，中国科学技术大学，博士
博士后及工作经历：
- 2019/11—2020/05，中国科学技术大学，博士后
- 2020/06—2022/06，清华大学，助理研究员
- 2022/7—2024/10，NuPhase Therapeutics，Director, Innovative Technology
- 2025/03—至今，上海科技大学, 生命科学与技术学院，助理教授（TENURE-TRACK）
课题组简介
研究内容：
实验室致力于从宏/介/微观的多尺度，综合生物相分离，人工智能，细胞/分子生物学，化学生物学，生物信息学，生物物理和疾病生物学等交叉领域或学科揭示不同分子网络在生理和病理系统下的底层逻辑，为临床获益提供科学基础。
研究成果展示
生物大分子等通过形成高度可塑化的动态结构—无膜细胞器，在基因表达调控、信号转导、细胞稳态、蛋白质合成等基本生物学过程中发挥不可替代的作用，而相关无膜细胞器异化与疾病发生发展高度相关。正常生理状态下，生物大分子通过相分离（phase separation）形成凝聚体（condensates），并高效稳健的广泛调控基础生命活动；但当其功能失调时，异常凝聚体可能促进包括肿瘤增殖、侵袭和转移，亦或导致神经退行性疾病，或引发神经发育疾病并最终产生宏观尺度的一系列临床症状。课题组综合利用交叉学科的优势点，集中力量瞄准生物大分子凝聚态网络组装异常的病理问题，寻找并验证面向临床的方法或策略。
Unpublished (12/4/2025)： # ODACs of Mutant Transcription Factors in Genetic Diseases. (Cell, In revision) # Super-enhancer-driven ZFPM2-AS1 maintains stemness via stress granules phase separation-mediated mitochondrial dynamics in breast cancer. (Submitted)
# RNA Phase-Separation Coating on the Chromosome. (In preparation, Invited review)
代表性论文（*第一作者，#通讯作者）
- 1. Mingrui Ding*, Danni Wang,* Hui Chen, Barry Kesner, Niklas-Benedikt Grimm, Uri Weissbein, Anna Lappala, Jiying Jiang, Carlos Rivera, Jizhong Lou, Pilong Li#, Jeannie T Lee#.A biophysical basis for the spreading behavior and limited diffusion of Xist.Cell. 20 Feb 2025 .
- 2. Mingrui Ding*, Weifan Xu*, Gaofeng Pei*, Pilong Li#.Long way up: rethink diseases in light of phase separation and phase transition.Protein Cell . 1 Jul 2024 .
- 3. Xiaoyu Song*, Fengrui Yang*, Tongtong Yang*, Yong Wang*, Mingrui Ding*, Linge Li*, Panpan Xu, Shuaiyu Liu, Ming Dai, Changbiao Chi, Shengqi Xiang, Chao Xu, Dong Li, Zhikai Wang, Lin Li , Donald L Hill, Chuanhai Fu, Kai Yuan, Pilong Li, Jianye Zang, Zhonghuai Hou, Kai Jiang, Yunyu Shi, Xing Liu#, Xuebiao Yao#.Phase separation of EB1 guides microtubule plus-end dynamics.Nat Cell Biol. 19 Dec 2022.
- 4. Xuezhao Feng*; Wanqing Du*; Mingrui Ding*; Wenkang Zhao; Xirenayi Xirefu; Meisheng Ma; Yuhui Zhuang; Xiaoyu Fu; Jiangfeng Shen; Jinpei Zhang; Xiuying Lei; Daxiao Sun; Qing Xi; Yiliyasi Aisa; Qian Chen; Ying Li; Wenjuan Wang; Shanjin Huang; Li Yu; Pilong Li#; Na Mi#.Myosin 1D and the branched actin network control the condensation of p62 bodies.Cell Res. 27 Apr 2022 .
- 5. Fengrui Yang*; Mingrui Ding*; Xiaoyu Song*; Fang Chen; Tongtong Yang; Chunyue Wang; Chengcheng Hu; Qing Hu; Yihan Yao; Shihao Du; Phil Y Yao; Peng Xia; Gregory Adams Jr; Chuanhai Fu; Shengqi Xiang; Dan Liu; Zhikai Wang#; Kai Yuan#; Xing Liu#.Organization of microtubule plus-end dynamics by phase separation in mitosis.J Mol Cell Biol. 29 Jul 2024 .
- 6. Mingrui Ding*, Jiying Jiang, Fengrui Yang, Fan Zheng, Jingwen Fang, Qian Wang, Jianyu Wang, William Yao, Xu Liu, Xinjiao Gao, McKay Mullen, Ping He, Cathy Rono, Xia Ding, Jingjun Hong, Chuanhai Fu, Xing Liu#, Xuebiao Yao#.Holliday junction recognition protein interacts with and specifies the centromeric assembly of CENP-T.J Biol Chem . 18 Jan 2019 .
- 7. Weifan Xu*, Mingrui Ding*, Pilong Li#.Struggle for survival: new insights into NELF condensation for adaptive transcriptional reprogramming.Mol Cell . 4 Mar 2021 .
专利
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1. 丁明瑞，许伟凡，张亮，基于凝聚体荧光漂白恢复技术 (Drop-FRAP) 的生物大分子相互 作用调节剂筛选平台.，中国，202410132162.4.，发明专利
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2. 许伟凡，丁明瑞，张亮. ，相分离骨架驱动的生物分子相互作用新型报告系统及其应用.，中国，202410126687.7.，发明专利
项目
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1. CLS基金，清华-北大生命科学联合中心，项目负责人
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2. 面上项目，中国博士后科学基金会，项目负责人
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3. 青年科学基金项目(C类)，国家自然科学基金委员会，项目负责人
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4. Joint research collaboration，Roche，项目负责人
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5. 2025年度上海市基础研究计划“⾃然科学基⾦”项⽬ ，上海市科学技术委员会，项目负责人
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6. 2025国家重点研发计划“生物大分子与微生物组”重点专项（青年科学家），中华人民共和国科学技术部，课题负责人
奖励
- 1. 2014，Cyrus Tang Scholarship
- 2. 2017，ASCB Travel Award
- 3. 2019，ITC Scholarship
- 4. 2021，Fellowship of CLS
- 5. 2024，卓越学者（清华大学）
- 6. 2024，未来科创家（清华大学，世纪长河基金会）
- 7. 2025，明珠计划 菁英人才
课题组成员及合影
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姓名：贺敬
身份：副研究员
在组时间：2025/9
邮箱：hejing@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：李哲昊
身份：博士研究生
在组时间：2025/04-至今
邮箱：lizhh4@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：陈嘉玥
身份：硕士研究生
在组时间：2025/02-至今
邮箱：chenjy32023@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：翟小雨
身份：硕士研究生
在组时间：2025/02-至今
邮箱：zhaixy2024@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：罗静轩
身份：硕士研究生
在组时间：2025/04-至今
邮箱：luojx2024@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：杨赵乐
身份：本科生
在组时间：2025/02-至今
邮箱：yangzhl2023@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：沈子胤
身份：本科生
在组时间：2025/02-至今
邮箱：shenzy2023@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：洪世伟
身份：硕士研究生
在组时间：2025/7
邮箱：
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姓名：王艺涵
身份：硕士研究生
在组时间：2025/7
邮箱：
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姓名：熊雯鋆
身份：硕士研究生
在组时间：2025/9
邮箱：
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姓名：代东阁
身份：硕士研究生
在组时间：2025/9
邮箱：
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姓名：欧毅成
身份：硕士研究生
在组时间：2025/11
邮箱：
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