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李洪杰, PhD助理教授 研究员 博士生导师

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蛋白质动态结构课题组

课题组长

姓名:

李洪杰助理教授 研究员 博士生导师, PhD, 助理教授

职务:

所在院所:

生命科学与技术学院&大科学中心

荣誉称号:

教育经历:
  • 2011/09—2015/07,吉林大学,学士
  • 2016/04—2021/06,日本兵库县立大学,博士
博士后及工作经历:
  • 2021/07—2024/07,日本冈山大学,博士后
  • 2024/07—至今,上海科技大学,助理教授 (Tenure-Track)

课题组简介

研究方向:
时间分辨串行飞秒晶体学(TR-SFX),蛋白质动态结构,分子电影
研究内容:

光是生命最重要的信息来源之一,也是研究蛋白质动态过程的天然探针。我们的研究致力于在原子分辨率下解析光如何驱动蛋白质运动,并揭示光信号产生与传递的分子机制。

生命活动中的许多关键过程都始于光信号的感知与转换。从微生物到人类,光受体蛋白能够将光能转化为生物信号,参与视觉形成、光合作用、生物钟调控、趋光运动以及细胞信号传导等重要生命活动。然而,光激发后的原子运动如何逐步传递,并最终产生生物学功能,仍然是生命科学领域的重要科学问题。

本课题组围绕光受体蛋白的结构、动态与功能开展研究,以结构生物学为核心,结合时间分辨X射线自由电子激光(XFEL)、冷冻电镜和X射线晶体学等研究手段,解析光受体蛋白在不同功能状态下的三维结构,捕获光激发过程中瞬时中间态,揭示光信号感知、传递与功能调控的分子机制。我们希望突破传统静态结构研究的局限,从动态结构的角度理解生命过程,并为光遗传学、荧光探针和光控生物技术的发展提供理论基础。


目前课题组主要围绕以下三个方向开展研究:

1. 光受体蛋白的结构与信号转导机制

光受体蛋白广泛存在于细菌、植物和动物中,是生命体感知外界光环境的重要分子基础。课题组以微生物视紫红质(Microbial Rhodopsins)、蓝细菌光受体(Cyanobacteriochromes, CBCRs)以及动物视觉相关光受体等为主要研究对象,解析其不同功能状态下的高分辨率结构,阐明光诱导构象变化、颜色调控(Color Tuning)及信号传递的结构基础,揭示不同类型光受体在进化过程中形成多样化功能的分子机制。

2. 时间分辨结构生物学

蛋白质并非静止的分子机器,而是在不断运动中完成其生物学功能。本课题组利用X射线自由电子激光(XFEL)等先进大科学装置,发展时间分辨结构生物学方法,捕获蛋白质在飞秒至毫秒时间尺度上的瞬时结构变化,解析光激发和酶催化过程中的关键中间态,构建蛋白质工作的动态结构图景(Molecular Movies),揭示结构变化与生物学功能之间的因果关系。

3. 光响应蛋白的理性设计与应用

基于对光受体结构和动态机制的理解,课题组进一步开展光响应蛋白的理性设计与功能优化。通过蛋白质工程改造光受体的光谱性质、稳定性及功能特性,探索其在近红外荧光成像、光遗传学以及人工光调控系统等领域的应用,为新型光功能蛋白和生物工具的开发提供结构基础和设计策略。


课题组网站:

研究成果展示

1. 在纳秒至毫秒时间尺度上拍摄了光系统 II(PSII)在S1-S2-S3状态转换过程的“分子电影”,阐明了放氧中心OEC裂解水分子的关键机理。(Nature 2024)

2.拍摄了C-C化学键生成的动态过程,揭示了C-H键活化中间态形成的分子机理。(Nature Chemistry 2022)



代表性论文(*第一作者,#通讯作者)

专著

专利

项目

奖励

  • 1. 2025年,2025年上海科技青年35人引领计划提名奖
  • 2. 2025年,2024年度国家优秀自费留学生奖学金(B类)
  • 3. 2024年,国家高层次海外人才计划青年项目
  • 4. 2024年,上海市浦江人才计划
  • 5. 2024年,上海市白玉兰人才计划青年人才
  • 6. 2024年,日本生物物理学会青年奖(Early Career Award in Biophysics)
  • 7. 2024年,IUPAB2024 Student and Early Career Researcher Poster Award

加入我们

  

课题组成员及合影

  • 姓名:李洪杰
    身份:研究员
    在组时间:2024/07-至今
    邮箱:lihj1@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:王天鑫
    身份:博士后
    在组时间:2026/07-至今
    邮箱:wangtx1@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:汪秋颖
    身份:工程师
    在组时间:2025/07-至今
    邮箱:wangqy6@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:罗佳璐
    身份:博士研究生
    在组时间:2025/01-至今
    邮箱:luojl12024@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:蔡圣豪
    身份:博士研究生
    在组时间:2025/01-至今
    邮箱:caishh2024@@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:李杰
    身份:博士研究生
    在组时间:2025/01-至今
    邮箱:lijie2024@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:吕少鹏
    身份:硕士研究生
    在组时间:2026/01-至今
    邮箱:lvshp2025@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:徐畅
    身份:硕士研究生
    在组时间:2026/01-至今
    邮箱:xuchang2025@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:陈如意
    身份:硕士研究生
    在组时间:2026/01-至今
    邮箱:chenry12025@shanghaitech.edu.cn
  • 姓名:王硕文
    身份:本科生
    在组时间:2025/03-2026/06
    邮箱:wangshw2022@shanghaitech.edu.cn

2025年2月



2025年7月


2026年1月


2026年3月


2026年7月

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