课题组长
姓名:
谭丹助理教授 研究员 博士生导师, PhD, 助理教授
职务:
所在院所:
生命科学与技术学院
荣誉称号:
教育经历:
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2005/09—2009/06,湖南师范大学,学士
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2009/09—2014/07,协和医学院/北京生命科学研究所,博士
博士后及工作经历:
- 2014/08—2016/12,北京生命科学研究所,博士后
- 2017/01—2023/01,美国Salk研究所,博士后
- 2023/01—2024/07,美国Salk研究所,Senior Research Associate
- 2024/07—至今,上海科技大学,助理教授
课题组简介
研究内容:
脂质是生命体系中重要且高度多样化的一类代谢物,不仅是细胞能量代谢的重要参与者和生物膜的基本组成成分,还可作为信号分子调控多种生理与病理过程。然而,由于脂质结构复杂、种类繁多且丰度跨度大,受现有分析技术限制,我们对脂质的分子多样性、生物学功能及其代谢调控机制仍缺乏系统认识。 基于质谱的脂质组学具有高灵敏度、高通量和高精度等优势,为系统解析复杂生物体系中的脂质提供了重要技术手段。我们课题组长期致力于开发和应用前沿脂质组学技术,结合临床样本、细胞与动物模型,以及化学生物学、生物信息学等交叉学科方法,研究脂质在重大疾病和关键生命过程中的生物学功能及其调控机制。 主要研究方向包括: 1. 开发脂质组学新技术 开发先进质谱分析方法和智能数据分析工具,实现更全面、更精准的脂质鉴定与定量。 2. 探索脂质“暗物质” 从未鉴定的质谱信号中发现新的脂质分子,解析其化学结构、调控网络及生物学功能,拓展我们对脂质世界及其生物学意义的认识。 3. 揭示脂质调控生理病理过程的机制 结合多组学、化学生物学、临床样本以及细胞与动物模型,研究脂质在衰老、神经退行性疾病和癌症等重要生理与病理过程中的功能及其调控机制,为疾病诊断与治疗提供新的理论基础和潜在靶点。
代表性论文(*第一作者,#通讯作者)
- 1. Tan, Dan*; Saghatelian, Alan#.The measurement, regulation and biological activity of FAHFAs.Nature Chemical Biology. 2025.
- 2. Tan, Dan*; Konduri, Srihari; Erikci Ertunc, Meric; Zhang, Pan; Wang, Justin; Chang, Tina; Pinto, Antonio FM; Rocha, Andrea; Donaldson, Cynthia J; Vaughan, Joan M; Ludwig, Raissa G; Willey, Elizabeth; Iyer, Manasi; Gray, Peter C; Maher, Pamela; Allen, Nicola J; Zuchero, J Bradley; Dillin, Andrew; Mori, Marcelo A; Kohama, Steven G; Siegel, Dionicio; Saghatelian, Alan#.A class of anti-inflammatory lipids decrease with aging in the central nervous system.Nature Chemical Biology. 2023.
- 3. Tan, Dan*; Ertunc, Meric Erikci; Konduri, Srihari; Zhang, Justin; Pinto, Antonio M; Chu, Qian; Kahn, Barbara B; Siegel, Dionicio#; Saghatelian, Alan#.Discovery of FAHFA-containing triacylglycerols and their metabolic regulation. Journal of the American Chemical Society.Journal of the American Chemical Society. 2019.
- 4. Tan, Dan*; Li, Qiang*; Zhang, Mei-Jun; Liu, Chao; Ma, Chengying; Zhang, Pan; Ding, Yue-He; Fan, Sheng-Bo; Tao, Li; Yang, Bing; Li, Xiangke; Ma, Shoucai; Liu, Junjie; Feng, Boya; Liu, Xiaohui; Wang, Hong-Wei; He, Si-Min; Gao, Ning; Ye, Keqiong; Dong, Meng-Qiu#; Lei, Xiaoguang#.Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and comparing protein conformational states.Elife. 2016.
- 5. Patel, Rucha*; Santoro, Anna; Hofer, Peter; Tan, Dan; Oberer, Monika; Nelson, Andrew T; Konduri, Srihari; Siegel, Dionicio; Zechner, Rudolf; Saghatelian, Alan; Kahn, Barbara B#.ATGL is a biosynthetic enzyme for fatty acid esters of hydroxy fatty acids.Nature. 2022.
- 6. Wang, Jian-Hua*; Tang, Yu-Liang*; Gong, Zhou; Jain, Rohit; Xiao, Fan; Zhou, Yu; Tan, Dan; Li, Qiang; Huang, Niu; Liu, Shu-Qun; Ye, Keqiong; Tang, Chun; Dong, Meng-Qiu#; Lei, Xiaoguang#.Characterization of protein unfolding by fast cross-linking mass spectrometry using di-ortho-phthalaldehyde cross-linkers.Nature Communications. 2022.
- 7. Martinez, Thomas F*; Chu, Qian; Donaldson, Cynthia; Tan, Dan; Shokhirev, Maxim N; Saghatelian, Alan#.Accurate annotation of human protein-coding small open reading frames.Nature Chemical Biology. 2020.
- 8. Erikci Ertunc, Meric*; Kok, Bernard P; Parsons, William H; Wang, Justin G; Tan, Dan; Donaldson, Cynthia J; Pinto, Antonio FM; Vaughan, Joan M; Ngo, Nhi; Lum, Kenneth M; Henry, Cassandra L; Coppola, Aundrea R; Niphakis, Micah J; Cravatt, Benjamin F; Saez, Enrique; Saghatelian, Alan#.AIG1 and ADTRP are endogenous hydrolases of fatty acid esters of hydroxy fatty acids (FAHFAs) in mice.Journal of Biological Chemistry. 2020.
- 9. Chu, Qian*; Martinez, Thomas F; Novak, Sammy Weiser; Donaldson, Cynthia J; Tan, Dan; Vaughan, Joan M; Chang, Tina; Diedrich, Jolene K; Andrade, Leo; Kim, Andrew; Zhang, Tong; Manor, Uri; Saghatelian, Alan#.Regulation of the ER stress response by a mitochondrial microprotein.Nature Communications. 2019.
- 10. Zhang, Xiaoyun*; Wang, Jian-Hua*; Tan, Dan; Li, Qiang; Li, Maodong; Gong, Zhou; Tang, Chun; Liu, Zhirong; Dong, Meng-Qiu#; Lei, Xiaoguang#.Carboxylate-selective chemical cross-linkers for mass spectrometric analysis of protein structures.Analytical Chemistry. 2018.
专利
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1. 雷晓光,李强,董梦秋,谭丹,一种多功能化学交联剂及其制备方法与应用,中国,CN107129455A[P],发明专利
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目前课题组正在招聘一位科研助理(详细信息参见学校招聘网页),请有意向者发送简历至tandan@shanghaitech.edu.cn。
课题组成员及合影
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姓名:陈丹
身份:工程师
在组时间:2026/1至今
邮箱:chendan@shanghaitech.edu.cn
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姓名:李一帆
身份:博士研究生
在组时间:2025/1至今
邮箱:liyf12024@shanghaitech.edu.cn
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姓名:刘攀
身份:博士研究生
在组时间:2025/1至今
邮箱:liupan2024@shanghaitech.edu.cn
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姓名:李晨阳
身份:硕士研究生
在组时间:2025/1至今
邮箱:lichy22024@shanghaitech.edu.cn
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姓名:孙奕菲
身份:硕士研究生
在组时间:2026/1至今
邮箱:sunyf2025@shanghaitech.edu.cn
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姓名:陆靖
身份:硕士研究生
在组时间:2026/1至今
邮箱:lujing2025@shanghaitech.edu.cn
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姓名:唐裕霞
身份:硕士研究生
在组时间:2026/1至今
邮箱:tangyx2025@shanghaitech.edu.cn
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