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蛋白质互作与翻译后修饰研究组

课题组长

姓名：

庄敏副教授研究员博士生导师, PhD, 副教授

职务：

所在院所：

生命科学与技术学院

荣誉称号：

教育经历：

1999/09—2003/07，南京大学，学士
2003/08—2009/07，美国田纳西大学健康医学中心／圣裘德儿童研究医院，博士

博士后及工作经历：

2009/08—2014/11，美国加州大学旧金山分校，博士后
2014/11—2021/11，上海科技大学，生命科学与技术学院，助理教授（TENURE-TRACK）
2021/11—至今，上海科技大学，生命科学与技术学院，副教授（TENURED）

课题组简介

研究方向：

蛋白质分子生物学

研究内容：

（1）综合利用生物化学、蛋白质组学、细胞生物学等研究手段，研究蛋白质相互作用和蛋白质的翻译后修饰对细胞器（线粒体、过氧化物酶体）的功能调控及其分子机制；

（2）利用蛋白质工程等手段开发发展新的生物技术工具。

课题组网站：

研究成果展示

发展了一种高效的催化标记系统用于研究膜蛋白的相互作用蛋白，并将其应用在细胞器表面的泛素连接酶，研究蛋白的翻译后修饰在细胞器上发生的分子机制，及其对细胞器的功能调控。通过标记细胞器的表面蛋白，一方面能够提高细胞器的纯化效率，另一方面为细胞器表面蛋白的动态变化研究提供有力的工具。

代表性论文（*第一作者，#通讯作者）

1. Huo, Yinbo*; Sun, Weiping; Shi, Tiezhu; Gao, Song; Zhuang, Min^#.The MFN1 and MFN2 mitofusins promote clustering between mitochondria and peroxisomes.COMMUNICATIONS BIOLOGY. 06 May 2022.
2. Zheng Jun*; Chen Xi^#*; Li Qiang; Zhong Guisheng; Zhuang Min^#.Ubiquitin ligase MARCH5 localizes to peroxisomes to regulate pexophagy.JOURNAL OF CELL BIOLOGY. 08 Nov 2021. 221(1):-.
3. Xie, Shu*; Li, Haixiang; Yao, Fenyong; Huang, Jiechang; Yang, Xiaomei; Chen, Xin; Liu, Qiang; Zhuang, Min; He, Shuijin.PUPIL enables mapping and stamping of transient electrical connectivity in developing nervous systems.CELL REPORTS. 2021. 37(3).
4. Chu, Yuanyuan*; Dong, Xingqi; Kang, Yingjin; Liu, Jingnan; Zhang, Tao; Yang, Cuiwei; Wang, Zhangshun; Shen, Wangchen; Huo, Huanhuan; Zhuang, Min; Lu, Junxia^#; Liu, Yanfen^#.The chaperone BAG6 regulates cellular homeostasis between autophagy and apoptosis by holding LC3B.ISCIENCE. Oct 2020. 23(11).
5. Zhang, Kun*; Cheng, Xiaoting*; Zhao, Liping*; Huang, Mingqian; Tao, Yong; Zhang, Hongbo; Rosenholm, Jessica M.; Zhuang, Min; Chen, Zheng-Yi; Chen, Bing^#; Shu, Yilai^#.Direct Functional Protein Delivery with a Peptide into Neonatal and Adult Mammalian Inner Ear In Vivo.MOLECULAR THERAPY-METHODS & CLINICAL DEVELOPMENT. 11 Sep 2020. 18:511-519.
6. Sun, Weiping*; Huo, Yinbo; Mei, Yuxuan; Zhou, Qingtong; Zhao, Suwen; Zhuang, Min^#.Identification of a Small Probe That Can Be Conjugated to Proteins by Proximity Labeling.ACS CHEMICAL BIOLOGY. Jan 2020. 15(1):39-43.
7. Zhang Ziheng*; Sun Weiping*; Shi Tiezhu*; Lu Pengfei^#; Zhuang Min^#; Liu Ji-Long^#.Capturing RNA-protein Interaction via CRUIS.NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 06 Mar 2020. 48(9):e52.
8. Xue, Dongxiang*; Ye, Lintao; Zheng, Jun; Wu, Yiran; Zhang, Xianjun; Xu, Yueming; Li, Tao; Stevens, Raymond C.; Xu, Fei; Zhuang, Min; Zhao, Suwen; Zhao, Fei^#; Tao, Houchao^#.The structure-based traceless specific fluorescence labeling of the smoothened receptor.ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY. 07 Jul 2019. 17(25):6136-6142.
9. Wang, Yuetong*; Cao, Jian; Liu, Weiwei; Zhang, Jiali; Wang, Zuo; Zhang, Yiqun; Hou, Linjun; Chen, Shengmiao; Hao, Piliang; Zhang, Liye; Zhuang, Min; Yu, Yang; Li, Dake; Fan, Gaofeng^#.Protein tyrosine phosphatase receptor type R (PTPRR) antagonizes the Wnt signaling pathway in ovarian cancer by dephosphorylating and inactivating βcatenin.JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. Nov 2019. 294(48):18306-18323.
10. Liu, Qiang*; Zheng, Jun; Sun, Weiping; Huo, Yinbo; Zhang, Liye; Hao, Piliang; Wang, Haopeng^#; Zhuang, Min^#.A proximity-tagging system to identify membrane protein-protein interactions.NATURE METHODS. Sep 2018. 15(9):715-+.
11. Srinivasan, Sharan R.*; Cesa, Laura C.; Li, Xiaokai; Julien, Olivier; Zhuang, Min; Shao, Hao; Chung, Jooho; Maillard, Ivan; Wells, James A.; Duckett, Colin S.; Gestwicki, Jason E.^#.Heat Shock Protein 70 (Hsp70) Suppresses RIP1-Dependent Apoptotic and Necroptotic Cascades.MOLECULAR CANCER RESEARCH. 2018. 16(1):58-68.
12. Lei, Liqun*; Chen, Hongquan*; Xue, Wei*; Yang, Bei*; Hu, Bian*; Wei, Jia; Wang, Lijie; Cui, Yiqiang; Li, Wei; Wang, Jianying; Yan, Lei; Shang, Wanjing; Gao, Jimin; Sha, Jiahao; Zhuang, Min; Huang, Xingxu; Shen, Bin^#; Yang, Li^#; Chen, Jia^#.APOBEC3 induces mutations during repair of CRISPR-Cas9-generated DNA breaks.NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY. Jan 2018. 25(1):45-52.
13. Hill, Zachary B.*; Pollock, Samuel B.; Zhuang, Min; Wells, James A.^#.Direct Proximity Tagging of Small Molecule Protein Targets Using an Engineered NEDD8 Ligase.JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 12 Oct 2016. 138(40):13123-13126.
14. Julien, Olivier*; Zhuang, Min; Wiita, Arun P.; O'Donoghue, Anthony J.; Knudsen, Giselle M.; Craik, Charles S.; Wells, James A.^#.Quantitative MS-based enzymology of caspases reveals distinct protein substrate specificities, hierarchies, and cellular roles.PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 05 Apr 2016. 113(14):E2001-E2010.
15. Ke, Qiong*; Li, Weiqiang; Lai, Xingqiang; Chen, Hong; Huang, Lihua; Kang, Zhuang; Li, Kai; Ren, Jie; Lin, Xiaofeng; Zheng, Haiqing; Huang, Weijun; Ma, Yunhan; Xu, Dongdong; Chen, Zheng; Song, Xinming; Lin, Xinyi; Zhuang, Min; Wang, Tao; Zhuang, Fengfeng; Xi, Jianzhong; Mao, Frank Fuxiang; Xia, Huimin; Lahn, Bruce T.; Zhou, Qi^#; Yang, Shihua^#; Xiang, Andy Peng^#.TALEN-based generation of a cynomolgus monkey disease model for human microcephaly.CELL RESEARCH. Sep 2016. 26(9):1048-1061.
16. Zhao, Lei*; Hu, Bo; Zhang, Yinsheng; Song, Yuan; Lin, Dandan; Liu, Yonghao; Mei, Yu; Sandikin, Dedy; Sun, Weiping; Zhuang, Min; Liu, Haiyan^#.An activation-induced IL-15 isoform is a natural antagonist for IL-15 function.SCIENTIFIC REPORTS. 11 May 2016. 6.

专著

专利

项目

奖励

1. 2015年，浦江人才
2. 2019年，国家自然科学基金优秀青年科学基金
3. 2016-2019，入选上海科技大学优秀教师
4. 2016、2018，入选上海科技大学书院“我最喜爱的导师“
5. 2020-至今，editorial board member, Communications Biology

课题组成员及合影

姓名：陈希

身份：助理研究员

在组时间：2019/05-至今

邮箱：chenxi2@@shanghaitech.edu.cn
姓名：郑骏

身份：博士后

在组时间：2021/07-至今

邮箱：zhengjun@@shanghaitech.edu.cn
姓名：张艳焕

身份：博士研究生

在组时间：2016/09-至今

邮箱：zhangyh1@@shanghaitech.edu.cn
姓名：霍银波

身份：博士研究生

在组时间：2016/09-至今

邮箱：huoyb@@shanghaitech.edu.cn
姓名：柳红琴

身份：博士研究生

在组时间：2017/09-至今

邮箱：liuhq@@shanghaitech.edu.cn
姓名：徐鹏

身份：博士研究生

在组时间：2017/09-至今

邮箱：xupeng@@shanghaitech.edu.cn
姓名：曹致和

身份：博士研究生

在组时间：2018/09-至今

邮箱：caozhh@@shanghaitech.edu.cn
姓名：朱欣然

身份：硕士研究生

在组时间：2018/09-至今

邮箱：zhuxr@@shanghaitech.edu.cn
姓名：吴建国

身份：博士研究生

在组时间：2020/05-至今

邮箱：wujg@shanghaitech.edu.cn
姓名：岳苏玉

身份：硕士研究生

在组时间：2019/09-至今

邮箱：yuesy@shanghaitech.edu.cn
姓名：梅宇轩

身份：硕士研究生

在组时间：2019/09-至今

邮箱：meiyx@shanghaitech.edu.cn